疫苗種類繁多，例如狗就有五合一、七合一、八合一、十合一和十一合一等疫苗；貓常見則有三合一、四合一和五合一等疫苗可以選擇。不論選擇施打哪一種綜合疫苗，都應該要至少包含犬貓的「核心疫苗」。

核心疫苗可以預防對犬貓來說，傳染性與死亡率最強的疾病。核心疫苗是不論被感染風險高低，每隻犬貓都應該要施打的疫苗內容，例如犬瘟熱、犬小病毒腸炎、貓瘟、貓白血病(僅一歲以前)等。其餘可以預防的疾病，依據選擇的綜合疫苗種類不同，項目也不同，應該依動物的個別情況決定是否施打，細節可以再與您的獸醫師討論。

有些動物雖然養在室內，但會偶爾去寵物美容院或出外散步的話，還是可能接觸到其它患病犬貓，或接觸到被排泄物或唾液等污染的環境。即使動物完全不出門，飼主觸摸其他貓狗，或踩到公園帶有病毒的泥土，仍可能間接傳染給家中的犬貓。例如，貓瘟病毒和犬小病毒腸炎的病源，可在環境中存活數週以上，且使用一般消毒劑例如酒精或肥皂，仍無法殺死。

因此，即使動物都養在室內，仍會建議注射基本的核心疫苗，降低傳染病的風險。

一般家犬貓的綜合疫苗，例如常聽到的貓三合一疫苗，犬多合一疫苗等，建議年齡至少滿6至8周齡再開始施打。這是因為剛出生的幼齡動物，會從媽媽身上獲得母源抗體，母源抗體可以保護幼年動物，但母源抗體也會影響疫苗的效力。因此會建議等到母源抗體逐漸退掉以後，再開始使打疫苗，才能獲得比較完整的免疫效力。

如果是要施打狂犬病疫苗，則年紀要更大一些，建議至少滿3個月齡再開始施打。

部分特殊狀況的犬貓，會更早開始施打疫苗，例如沒有喝到初乳或高風險環境的犬貓，請和您的獸醫師討論，依情況調整疫苗計劃。

除了年齡應至少滿6至8周齡以外，動物應該要驅過寄生蟲，而且經獸醫檢查確認身體健康，再施打疫苗最為理想。假如是剛從傳染病風險較高的地方領養出來的動物（例如收容所或繁殖場等），建議至少觀察兩周，確認動物沒有潛伏的傳染病，再施打疫苗。

如果在動物生病的情況下，幫動物施打疫苗，可能會影響到疫苗的效力，大多會建議延後施打時間，等動物康復以後再施打。假如動物雖然有生病，但症狀輕微，而且真的有必要施打疫苗，獸醫師則會評估動物狀況和整體風險，再決定是否施打。

需注意，懷孕的犬貓不建議施打疫苗，如果真的有特殊需求必須施打，也應該選用死毒疫苗來進行注射，而非一般動物醫院使用的活毒疫苗。

根據目前最新的獸醫疫苗施打建議，動物應該從6至8周齡開始施打核心疫苗，之後每2到4週就補強施打一次，直到動物滿16週大為止。

簡單來說，假如您的寶貝是從8週齡開始施打，後續就應該每4週補強一次，到施打滿三劑疫苗為止。 但如果動物在不到8齡時，已經開始施打疫苗，就需要打到第四劑疫苗，甚至第五劑，才能完成整個疫苗計劃。假如您的動物年紀已經超過16週才開始施打核心疫苗，大部分情況，只需要施打兩劑就足夠。

以上討論的計畫為核心疫苗，若是其他種類疫苗，施打年齡和補強方式不一定相同，可以再與您的獸醫師討論。

完成幼年的基礎疫苗以後，未來還是應該定期補強來維持保護效力。應該多久補強一次呢？最常採取的做法是每年補強一次，不過實際上，還是可以依據環境風險，以及希望預防的疾病種類，調整補打的頻率。

舉例來說，施打貓三合一疫苗的動物，如果想要確保其中貓瘟病毒的保護力，只要三年補強一次就足夠。但三合一疫苗中的另外兩項病毒：貓皰疹病毒和貓卡里西病毒，就需每年補強才能維持保護效力。所以仍應依據每隻貓的狀況，與獸醫師討論調整。